El presente artículo tiene como objetivo analizar la trayectoria de la arqueología académica universitaria en Brasil, a partir de una perspectiva institucional del Estado de São Paulo. Se opta por una visión externa de la Historia de la Ciencia, insertando la ciencia misma en un contexto social más amplio. Con ese objetivo, recorreremos la fundación de la Universidad de São Paulo y la institucionalización de las relaciones intelectuales con Francia, en las décadas de 1930 y 1940: las acciones de Paulo Duarte, humanista brasileño responsable, entre otras realizaciones, por la fundación del Instituto de Prehistoria; el Golpe Militar y sus consecuencias en algunas de las prácticas de la Arqueología Universitaria, llegando, finalmente, a la democratización política en la década de 1980 y la inserción de la investigación brasileña en el escenario internacional.